2018年以來，按照國家農村牧區人居環境整治三年行動要求，內蒙古巴彥淖爾市制訂了《農村牧區人居環境整治三年行動實施方案》，緊緊圍繞“生態宜居”的戰略目標，以“天賦河套”區域公用品牌為引領，建設全域綠色有機高端農畜產品生產加工輸出基地，堅定不移走生態優先、綠色發展的高質量發展路子，全力推進農村牧區人居環境整治，建設美麗鄉村，全市農村牧區人居環境整治工作取得顯著成效。
在提升村容村貌方面，目前，巴彥淖爾市完成村莊環境綜合整治100個；新改建農村牧區公路1500公里，全市農村牧區公路達到1.98萬公里（村道13770公里），所有建制嘎查村都通了客車；城鄉物流配送實現了無縫銜接（“交郵結合”“互聯網+物流”）；農村牧區集中供水率達98%；3136個村莊建立健全了衛生保潔、設施維護、村規民約等后續管護機制；創建綠色村莊2893個，達標率68%。
在清理生活垃圾方面，目前，巴彥淖爾市已建成垃圾中轉站72個、焚燒處理設施10個、配備環衛車162臺（輛）、購置垃圾桶（箱）3萬余個，完成2678個村莊的垃圾治理，治理率達63%。
在集中治理生活污水方面，該市主要依托城鎮污水處理廠、新建污水處理設施、排入自家廁所用于農業生產等方法處理。建成農村集鎮污水處理廠10個，新增污水管網31公里。
在開展“廁所革命”方面，全市選擇三格式化糞池、無動力蒸發式和復合酵素等處理工藝，已完成入戶水沖廁所改造14360戶。積極推進農牧業生產廢棄物資源化利用，推廣經濟高效、可持續運行的畜禽養殖廢棄物綜合利用模式，通過實施磴口縣和杭錦后旗兩個國家糞污資源化利用整縣推進項目，全市畜禽糞污資源化利用率達70%；以臨河、杭錦后旗兩個秸稈綜合利用示范縣為引領，實施農作物秸稈飼料化、肥料化、原料化、能源化利用工程建設，農作物秸稈綜合利用率達83%以上。
2019年，巴彥淖爾市編制印發了《巴彥淖爾市2019年農村牧區人居環境整治工作指導意見》《巴彥淖爾市2019年農村牧區人居環境整治實施細則》《巴彥淖爾市2019年農村牧區人居環境整治“十縣百鄉千村”示范行動實施方案》等系列指導性文件，制定了任務書、時間表和路線圖。
目前，各項工作有序推進，4000個自然村開展了“三清一改”整治工作，廁所改建已開建200戶，21個垃圾轉運站正在辦理先期手續，14個污水處理場正在進行招投標和前期準備工作；“四好農村路”建設已完成投資5000多萬元，1608個畜禽規模養殖場糞污處理設施配套任務已開工建設531個。
